Rund 3 km von der Yamanote-Thermalquelle entfernt gelegen, bietet das Hotel Zen Hakodate 21 Zimmer an.
Das Hotel liegt in einer Entfernung von ca. 15 Fahrminuten vom Kunstmuseum von Hakodate und in einer Entfernung von ca. 10 Fahrminuten vom Bahnhof Hakodate. Das Trappistinnenkloster Hakodate gilt als heilige Stätte und liegt in ungefähr 4 km Entfernung vom Hotel. Die Lage in einer Entfernung von ca. 20 Fahrminuten vom Goryokaku Tower ist ein großer Vorteil für Gäste vom Zen.
Die Badezimmer verfügen über ein Bidet, eine getrennte Toilette und eine Dusche sowie über Annehmlichkeiten wie einen Haartrockner und Badelaken.